Воспитательная работа в Колледжа строится в соответствии с Концепцией воспитательной деятельности Владивостокского морского колледжа, Программой воспитательной работы с курсантами ПОАНО «ВМК» на цикл (период) обучения, Программой по первичной профилактике правонарушений курсантов ПОАНО «ВМК», Программой по первичной профилактике наркотической, алкогольной, никотиновой и иных видов зависимостей, а также ВИЧ-инфекций у курсантов Владивостокского морского колледжа и перспективного плана воспитательной работы на весь период обучения, который охватывает все курсы с детальной помесячной планировкой. Воспитательная работа с курсантами направлена на повышение успеваемости, укрепление дисциплины, усиление нравственного и этического воспитания. Основная работа по воспитанию проводится через учебную группу, родителей и индивидуально с учащимися.
В Колледже действует Рейтинговая система оценки деятельности, направленная на обеспечение объективности оценивания как позитивной, так и негативной деятельности курсантов. Начальник организационно-воспитательного отдела и классные руководители, осуществляют ежедневный контроль за посещаемостью занятий, внешним видом и поведением учащихся. Один раз в семестр, а по необходимости и чаще, проводятся родительские собрания по группам, и это помогает обеспечивать поддержание успеваемости и дисциплины курсантов на должном уровне.